1.使用前先將電源插頭固定牢靠后，再打開機器開關。插頭不能使其出現松動，因為機器工作時會產生振動導致插頭脫落。這種突然短點對機器會造成損傷。

2.均質器工作時不準隨便打開均質器門，防止樣液飛濺（有的均質器打開門以后自動停止拍擊均質） ，一定要先關機器再開門，然后同樣關閉門之后再開機。

3.使用均質器之前，一定要檢查均質器內是否有異物，防止損傷機械裝置或均質袋。

4.堅硬樣品，盡量不要用拍打式均質器，防止均質袋破裂，冷凍樣品需緩化解凍以后才能使用拍擊式均質器。當一定要拍打堅硬樣品時，最好加套均質袋。

5.均質器的底部是空的，如遇均質袋意外破裂時，方便清理溢出物。

6.均質器和均質袋放置在陰涼干燥處，特別是均質袋應避酸堿、避陽光，防止其過早的變脆老化。

7.均質器用完之后，先關機斷電，然后將其內外清理干凈。

8.對于一些拍打均質后，容易堵塞移液管或移液器槍頭的樣品，建議使用帶過濾網的無菌均質袋。